La subgerencia de Deporte Asociado y Altos Logros de Indeportes Antioquia nació en 1997, cuando el Diego Palacios Gutiérrez era el gerente de la Entidad. El primer subgerente de esta área en Indeportes Antioquia fue Luis Fernando Begué Trujillo, quien después llegó a la gerencia de la Entidad. A Begué, en la subgerencia, lo sucedió el exnadador Alejandro Bermúdez.

En esta subgerencia están unidas todas las áreas que tienen que ver con el desarrollo integral del deportista: metodólogos, médicos, nutricionistas, bacteriólogos, psicólogos, fisiólogos, odontólogos y personas del área social. Ellos integran el cúmulo de profesionales que, desde su perspectiva profesional, aportan para que los atletas del departamento de Antioquia tengan de su lado todas las facilidades que les permitan conseguir un alto rendimiento deportivo. Sin embargo, conectado al alto rendimiento, de manera indisoluble, están los centros de desarrollo deportivo que son la cantera natural que sirve de reserva a los deportistas que ya están en la cúspide del deporte antioqueño..